| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
|
Data corrente: |
26/08/2014 |
|
Data da última atualização: |
19/06/2017 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
GOMES, D. F.; BATISTA, J. S. da S.; ROLLA, A. A. P.; SILVA, L. P. da; BLOCH, C.; GALLI-TARASAWA, L. V.; HUNGRIA, M. |
|
Afiliação: |
DOUGLAS FABIANO GOMES, Departamento de Génetica UFPR; JESSIANE STEFÂNIA DA SILVA BATISTA, DEBIOGEM UEPG; AMANDA ALVES PAIVA ROLLA; LUCIANO PAULINO DA SILVA, CENARGEN; CARLOS BLOCH JUNIOR, Cenargen; LYGIA VITORIA GALLI TERASAWA, Departamento de Génetica UFPR; MARIANGELA HUNGRIA DA CUNHA, CNPSO. |
|
Título: |
Proteomic analysis of free-living Bradyrhizobium diazoefficiens: highlighting potential determinants of a successful symbiosis |
|
Ano de publicação: |
2014 |
|
Fonte/Imprenta: |
BMC Genomics, v. 15, n. 643, 2014. |
|
DOI: |
10.1186/1471-2164-15-643 |
|
Idioma: |
Português |
|
Conteúdo: |
Strain CPAC 7 (=SEMIA 5080) was recently reclassified into the new species Bradyrhizobium diazoefficiens; due to its outstanding efficiency in fixing nitrogen, it has been used in commercial inoculants for application to crops of soybean [Glycine max (L.) Merr.] in Brazil and other South American countries. Although the efficiency of B. diazoefficiens inoculant strains is well recognized, few data on their protein expression are available. We provided a two-dimensional proteomic reference map of CPAC 7 obtained under free-living conditions, with the successful identification of 115 spots, representing 95 different proteins. The results highlighted the expression of molecular determinants potentially related to symbiosis establishment (e.g. inositol monophosphatase, IMPase), fixation of atmospheric nitrogen (N 2) (e.g. NifH) and defenses against stresses (e.g. chaperones). By using bioinformatic tools, it was possible to attribute probable functions to ten hypothetical proteins. For another ten proteins classified as? NO related COG? group, we analyzed by RT-qPCR the relative expression of their coding-genes in response to the nodulation-gene inducer genistein. Six of these genes were up-regulated, including blr0227, which may be related to polyhydroxybutyrate (PHB) biosynthesis and competitiveness for nodulation. The proteomic map contributed to the identification of several proteins of B. diazoefficiens under free-living conditions and our approach? combining bioinformatics and gene-expression assays ? resulted in new information about unknown genes that might play important roles in the establishment of the symbiosis with soybean. MenosStrain CPAC 7 (=SEMIA 5080) was recently reclassified into the new species Bradyrhizobium diazoefficiens; due to its outstanding efficiency in fixing nitrogen, it has been used in commercial inoculants for application to crops of soybean [Glycine max (L.) Merr.] in Brazil and other South American countries. Although the efficiency of B. diazoefficiens inoculant strains is well recognized, few data on their protein expression are available. We provided a two-dimensional proteomic reference map of CPAC 7 obtained under free-living conditions, with the successful identification of 115 spots, representing 95 different proteins. The results highlighted the expression of molecular determinants potentially related to symbiosis establishment (e.g. inositol monophosphatase, IMPase), fixation of atmospheric nitrogen (N 2) (e.g. NifH) and defenses against stresses (e.g. chaperones). By using bioinformatic tools, it was possible to attribute probable functions to ten hypothetical proteins. For another ten proteins classified as? NO related COG? group, we analyzed by RT-qPCR the relative expression of their coding-genes in response to the nodulation-gene inducer genistein. Six of these genes were up-regulated, including blr0227, which may be related to polyhydroxybutyrate (PHB) biosynthesis and competitiveness for nodulation. The proteomic map contributed to the identification of several proteins of B. diazoefficiens under free-living conditions and our approach? combining bioinformatics... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
RT-qPCR; Two-dimensional proteomics. |
|
Thesaurus Nal: |
Bradyrhizobium; nitrogen fixation; symbiosis. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/160837/1/12864-2014-Article-6775.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02463naa a2200265 a 4500
001 1993458
005 2017-06-19
008 2014 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.1186/1471-2164-15-643$2DOI
100 1 $aGOMES, D. F.
245 $aProteomic analysis of free-living Bradyrhizobium diazoefficiens$bhighlighting potential determinants of a successful symbiosis$h[electronic resource]
260 $c2014
520 $aStrain CPAC 7 (=SEMIA 5080) was recently reclassified into the new species Bradyrhizobium diazoefficiens; due to its outstanding efficiency in fixing nitrogen, it has been used in commercial inoculants for application to crops of soybean [Glycine max (L.) Merr.] in Brazil and other South American countries. Although the efficiency of B. diazoefficiens inoculant strains is well recognized, few data on their protein expression are available. We provided a two-dimensional proteomic reference map of CPAC 7 obtained under free-living conditions, with the successful identification of 115 spots, representing 95 different proteins. The results highlighted the expression of molecular determinants potentially related to symbiosis establishment (e.g. inositol monophosphatase, IMPase), fixation of atmospheric nitrogen (N 2) (e.g. NifH) and defenses against stresses (e.g. chaperones). By using bioinformatic tools, it was possible to attribute probable functions to ten hypothetical proteins. For another ten proteins classified as? NO related COG? group, we analyzed by RT-qPCR the relative expression of their coding-genes in response to the nodulation-gene inducer genistein. Six of these genes were up-regulated, including blr0227, which may be related to polyhydroxybutyrate (PHB) biosynthesis and competitiveness for nodulation. The proteomic map contributed to the identification of several proteins of B. diazoefficiens under free-living conditions and our approach? combining bioinformatics and gene-expression assays ? resulted in new information about unknown genes that might play important roles in the establishment of the symbiosis with soybean.
650 $aBradyrhizobium
650 $anitrogen fixation
650 $asymbiosis
653 $aRT-qPCR
653 $aTwo-dimensional proteomics
700 1 $aBATISTA, J. S. da S.
700 1 $aROLLA, A. A. P.
700 1 $aSILVA, L. P. da
700 1 $aBLOCH, C.
700 1 $aGALLI-TARASAWA, L. V.
700 1 $aHUNGRIA, M.
773 $tBMC Genomics$gv. 15, n. 643, 2014.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 27 | |
| 1. |  | PEREIRA, S. S.; STOLF, R.; ROLLA, A. A. P.; FUGANTI, R.; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO F. C.; NEPOMUCENO, A. L. Análise da expressão de fatores de transcrição relacionados com tolerância à seca, em soja, através da técnica de PCR em tempo real. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 54., 2008, Salvador. Resumos... Salvador: SBG, 2008. p. 245.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
|   |
| 2. | | ROLLA, A. A. P.; BENEVENTI, M. A.; FUGANTI, R.; MARIN, S. R. R.; FARIAS, J. R. B.; BINNECK, E.; ABDELNOOR, R. V.; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO, F. C. Desenvolvimento e validação de um método de determinação do número de cópias de transgenes no genoma da soja por quantificação relativa por QPCR. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 5.; MERCOSOJA 2009, Goiânia. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2009. p. 100, trab. 168. Editado por Adilson de Oliveira Júnior, Odilon Ferreira Saraiva, Clara Beatriz Hoffmann Campo, César de Castro.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 3. | | ROLLA, A. A. P.; BENEVENTI, M. A.; FUGANTI, R.; MARIN, S. R. R.; FARIAS, J. R. B.; ABDELNOOR, R. V.; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO, F. C. Method validation for quantification of transgene copy number in soybean genome using qPCR relative quantification by 2 -^^ Ct or 2 ^ Ct formule. In: WORLD SOYBEAN RESEARCH CONFERENCE, 8., 2009, Beijing. Developing a global soy blueprint for a safe secure and sustainable supply: abstracts. Beijing: Chinese Academy of Agricultural Sciences: Institute of Crop Science, 2009. p. 233, ref. P581. WSRC 2009. Editado por Lijuan Qiu, Rongxia Guan, Jian Jin, Qijan Song, Shuntang Guo, Wenbin Li, Yuanchao Wang, Tianfu Han, Xiaobing Liu, Deyue Yu, Lianzhou Jiang, Deliang Peng.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 4. | | PEREIRA, S. S.; STOLF, R.; ROLLA, A. A. P.; FUGANTI, R.; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO, F. C.; NEPOMUCENO, A. L. Expression analysis of transcription factors involved in drought tolerance in soybean roots. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE GENÉTICA MOLECULAR DE PLANTAS, 2., 2009, Búzios. Programa e resumos. [S.l.]: SBG, 2009. p. 160.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 5. | | LOPES, V. S.; ROLLA, A. A. P.; LIMA, D. de; DOMIT, L. A.; DALBOSCO, M.; MIRANDA, L. C.; MARCELINO, F. C. Monitoramento da cadeia produtiva da soja: identificação de pontos críticos e nível de contaminação entre cultivos de soja convencional e transgênica resiste a glifosato. In: SIMPÓSIO DE CIÊNCIAS AMBIENTAIS DO NORTE DO PARANÁ, 2., 2009, Bandeirantes. [O Desafio do desenvolvimento sustentável: resumos.]. Bandeirantes: UENP, 2009. 4 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
|  |
| 6. | | GOMES, D. F.; BATISTA, J. S. da S.; ROLLA, A. A. P.; SILVA, L. P. da; BLOCH, C.; GALLI-TARASAWA, L. V.; HUNGRIA, M. Proteomic analysis of free-living Bradyrhizobium diazoefficiens: highlighting potential determinants of a successful symbiosis BMC Genomics, v. 15, n. 643, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 8. | | KANAMORI, N.; GIROTTO, L.; SANCHES B. B.; LEITE J. P.; ENGELS, C.; ROLLA, A. A. P.; FUGANTI, R.; NEUMAIER, N.; FARIAS, J. R. B.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO, F. C.; NEPOMUCENO, A. L. Agrobacterium-mediated transformation of brazilian soybean cultivar, BR 16. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 5.; MERCOSOJA 2009, Goiânia. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2009. p.105, trab. 177. Editado por Adilson de Oliveira Júnior, Odilon Ferreira Saraiva, Clara Beatriz Hoffmann Campo, César de Castro.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 9. | | SALINET, L. H.; FARIAS, J. R. B.; NEUMAIER, N.; BENEVENTI, M. A.; ROLLA, A. A. P.; POLIZEL, A. M.; MARIN, S. R. R.; ENGELS, C.; OLIVEIRA, R. F. de; OLIVEIRA, M. C. N. de; NEPOMUCENO, A. L. Avaliação fisiológica e agronômica de soja geneticamente modificada visando maior tolerância à seca. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 5.; MERCOSOJA 2009, Goiânia. Anais... Londrina: Embrapa Soja, 2009. Seção trabalhos, t. 173. 1 CD-ROM. Editado por Adilson de Oliveira Júnior, Odilon Ferreira Saraiva, Clara Beatriz Hoffmann Campo, César de Castro.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 10. | | ENGELS, C.; FUGANTI, R.; RODRIGUES, F. A.; GIROTTO, L.; LEITE J. P.; ROLLA, A. A. P.; MARIN, S. R. R.; SILVEIRA, C. A.; FARIAS, J. R. B.; MARCELINO, F. C.; ABDELNOOR, R. V.; YAMAGUCHI-SHINOZAKI, K.; NEPOMUCENO, A. L. Obtenção e caracterização de plantas de soja (Glycine max) geneticamente modificadas visando maior tolerância à seca. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 5.; MERCOSOJA 2009, Goiânia. Anais... Londrina: Embrapa Soja, 2009. Seção trabalhos, t. 176. 1 CD-ROM. Editado por Adilson de Oliveira Júnior, Odilon Ferreira Saraiva, Clara Beatriz Hoffmann Campo, César de Castro.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 11. | | LEITE, J. P.; KANAMORI, N.; FUGANTI, R.; GIROTTO, L.; ROLLA, A. A. P.; ENGELS, C.; MARINHO, J. P.; FARIAS, J. R. B.; NEUMAIER, N.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO, F. C.; YAMAGUCHI-SHINOZAKI, K.; NEPOMUCENO, A. L. Obtenção de plantas de soja geneticamente modificadas via Agrobacterium tumefaciens. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 4., 2009, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2009. p. 130-133. (Embrapa Soja. Documentos, 312). Editado por Odilon Ferreira Saraiva, Paula Geron Saiz Melo.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 12. | | LOPES, V. S.; ROLLA, A. A. P.; FILHO, P. J. C.; KUWAHARA, M. K.; PASSIANOTO, A. L. de L.; LIMA, D.; DOMIT, L. A.; DALBOSCO, M.; MIRANDA, L. C.; MARCELINO, F. C. Identificação de pontos críticos de contaminação cruzada entre cultivos transgênicos e convencional na cadeia produtiva da soja. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 5.; MERCOSOJA 2009, Goiânia. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2009. p. 105, trab. 178. Editado por Adilson de Oliveira Júnior, Odilon Ferreira Saraiva, Clara Beatriz Hoffmann Campo, César de Castro.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 13. | | STOLF-MOREIRA, R.; LEMOS, E. G. de M.; ABDELNOOR, R. V.; BENEVENTI, M. A.; ROLLA, A. A. P.; PEREIRA, S. dos S.; OLIVEIRA, M. C. N. de; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Identification of reference genes for expression analysis by real-time quantitative PCR in drought-stressed soybean. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 46, n. 1, p. 58-65, jan. 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja; Embrapa Unidades Centrais. |
| |
| 14. | | ROLLA, A. A. P.; KANAMORI, N.; FUGANTI-PAGLIARINI, R.; MARIN, S. R. R.; ENGLES, C.; YAMAGUCHI-SHINOZAKI; FARIAS, J. R. B.; NEUMAIER, N.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO, F. C.; NEPOMUCENO, A. L. Molecular characterization of genetically modified soybean lines developed aiming to obtain drought tolerance. In: BRAZILIAN SYMPOSIUM ON PLANT MOLECULAR BIOLOGY, 3., 2011, Ilhéus. [Abstracts...]. [Ribeirão Preto]: SBG, 2011. 1 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 15. | | ROLLA, A. A. P.; BENEVENTI, M. A.; FUGANTI, R.; PEREIRA, S. S.; MARIN, S. R. R.; FARIAS, J. R. B.; LOPES, V. S.; YAMAGUCHI -SHINOZAKI, K.; BINNECK, E.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO, F. C.; NEPOMUCENO, A. L. Quantification of transgene copies in soybean genome using quantitative real time PCR through absolute and relative methodologies. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE GENÉTICA MOLECULAR DE PLANTAS, 2., 2009, Búzios. Programa e resumos. [S.l.]: SBG, 2009. p. 167.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 16. | | BENEVENTI, M. A.; NEPOMUCENO, A. L.; YAMANAKA, N.; SHINOZAKI, K. Y.; NAKASHIMA, K.; BINNECK, E.; FARIAS, J. R. B.; MARIN, S. R. R.; SILVEIRA, C. A.; LUGLE, S. M.; ROLLA, A. A. P.; POLIZEL, A. M. Transformação genética em soja (Glycine max (L)Merril) visando tolerância à seca. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 51., 2005, Águas de Lindóia. Resumos... Águas de Lindóia: SBG, 2005. 1 CD-ROM. Seção: Genética e Melhoramento - Resumos: Pdf.634.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 17. | | BENEVENTI, M. A.; NEPOMUCENO, A. L.; YAMANAKA, N.; SHINOZAKI, K. Y.; NAKASHIMA, K.; BINNECK, E.; FARIAS, J. R. B.; MARIN, S. R. R.; SILVEIRA, C. A.; LUGLE, S. M.; ABDELNOOR, R. V.; ROLLA, A. A. P.; POLIZEL, A. M. Transformação genética de soja com promotor e fator de transcrição estresse induzidos visando tolerancia à seca. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 27., 2005. Cornélio Procópio. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2005. p. 108-109. (Embrapa Soja. Documentos, 257). Organizado por Odilon Ferreira Saraiva, Janete Lasso Ortiz, Simone Ery Grosskopf.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 18. | | PEREIRA, S. S.; GUIMARÃES, F. C. M.; CARVALHO, J. F. C.; STOLF-MOREIRA, R.; OLIVEIRA, M. C. N.; ROLLA, A. A. P.; FARIAS, J. R. B.; NEUMAIER, N.; NEPOMUCENO, A. L. Transcription factors expressed in soybean roots under drought stress. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 10, n. 4, p. 3689-3701, Oct. 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 19. | | ENGELS, C.; FUGANTI, R.; RODRIGUES, F. A.; KANAMORI, N.; ROLLA, A. A. P.; MARIN, S. R. R.; FARIAS, J. R. B.; NEUMAIER, N.; MARCELINO, F. C.; MIZOI, J.; YAMAGUCHI-SHINOZAKI, K.; NEPOMUCENO, A. L. Transgene copy number quantification by qPCR in GM soybean lines containing the rd29A:AtDREB2A construction. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIOTECNOLOGIA, 3., 2010, Fortaleza. Programa e resumos. Brasília, DF: SBBiotec, 2010. p. 197.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 20. | | ENGELS, C.; FUGANTI, R.; RODRIGUES, F. A.; GIROTTO, L.; SANCHES B. B.; LEITE J. P.; ROLLA, A. A. P.; MARIN, S. R. R.; SILVEIRA, C. A.; FARIAS, J. R. B.; MARCELINO, F. C.; ABDELNOOR, R. V.; SHINOZAKI, K.; NEPOMUCENO, A. L. Obtenção e caracterização de plantas de soja (Glycine max) geneticamente modificadas visando maior tolerância à seca. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 5.; MERCOSOJA 2009, Goiânia. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2009. p.104, trab. 176. Editado por Adilson de Oliveira Júnior, Odilon Ferreira Saraiva, Clara Beatriz Hoffmann Campo, César de Castro.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| Registros recuperados : 27 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
